善化區(qū)在清朝時(shí)名臺(tái)南府安平縣灣里街設(shè)“巡司”統(tǒng)轄。甲午戰(zhàn)爭(zhēng)割讓臺(tái)灣后，日治時(shí)期:1895年(明治28年)改為“曾文兵站司令部”，管轄分為善化里東堡及西堡為行政管理區(qū)域。1896年(明治29年)地區(qū)劃歸于“曾文憲兵屯兵所”，同年實(shí)施民政改為“臺(tái)南市灣里辦務(wù)署”。1898年(明治31年)編入大目降(新化)辦務(wù)署，改為“灣里辦務(wù)支署”。1900年(明治33年)實(shí)施街莊社制度，分善化東區(qū)及西區(qū)，設(shè)區(qū)長(zhǎng)統(tǒng)轄。1902年(明治35年)實(shí)施地方制度。兩區(qū)合并為“善化莊”置莊役場(chǎng)。1940年(昭和15年)6月17日升格為“善化街”設(shè)街役場(chǎng)。 二戰(zhàn)后國(guó)民于1946年(民國(guó)35年)1月20日臺(tái)灣省鄉(xiāng)鎮(zhèn)組織規(guī)程實(shí)施改為善化區(qū)，設(shè)善化區(qū)公所，本區(qū)劃分21里。

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